1986年，青岛化工学院设置工业分析和精细化工两个专科专业

1988年，青岛化工学院应用化学系成立，工业分析和精细化工两个专科专业升级为本科专业

1990年，应用化学系获得应用化学二级学科硕士学位授予权

1995年，精细化工专业从应用化学系调整出来，成立精细化工系，后并入化工学院

1996年，应用化学系增设材料化学本科专业，2006年专业调整并入材料科学与工程学院  

1998年，应用化学系获得分析化学二级学科硕士学位授予权

1999年，工业分析专业变更名称为应用化学专业

1999年，应用化学系增设工业分析与检验专业（学制三年），2014年停止招生

2001年，应用化学系更名为化学与分子工程学院

2002年，化学与分子工程学院增设环境工程本科专业，2006年专业调整并入环境与安全工程学院

2002年，化学与分子工程学院增设化学本科专业

2002年，应用化学获批山东省重点学科

2003年，化学与分子工程学院获得应用化学二级学科博士学位授予权

2004年，化学与分子工程学院增设海洋科学本科专业，2017年专业调整并入海洋科学与生物工程学院

2005年，化学与分子工程学院获得化学一级学科硕士学位授予权

2007年，化学与分子工程学院获得海洋化学二级学科硕士学位授予权

2008年，生态化工教育部重点实验室获批成立，2018年更名为光电传感与生命分析教育部重点实验室

2008年，“化工类专业化学系列课程教学团队”获批国家级教学团队

2009年，化学与分子工程学院获批设立化学博士后流动站

2009年，应用化学专业获批国家级特色专业

2009年，基础化学实验中心获批山东省实验教学示范中心

2010年，生态化工国家重点实验室培育基地获批成立

2011年，化学与分子工程学院增设应用化学（中美）本科专业，为青岛科技大学与美国特洛伊大学合作办学项目

2011年，生化分析创新团队入选教育部“长江学者和创新团队发展计划”；2015年，验收优秀获滚动支持

2012年，“工科有机化学系列课程教学团队”获批省级教学团队

2017年，化学学科入选山东省“一流学科”

2017年，教育部发布全国第四轮学科评估结果，化学学科处于B档，并列全国第31位

2018年，化学与分子工程学院增设分子科学与工程本科专业

2018年，化学与分子工程学院获得化学一级学科博士学位授予权

2019年，“基础化学教学团队”入选全国石油和化工教育优秀教学团队

2019年，《海洋中的电化学腐蚀与防护》入选国家级虚拟仿真实验教学项目，2021年入选国家级一流课程

2019年，应用化学和化学专业入选山东省一流专业建设点

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